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Aufgrund seiner Parteinahme für König Rudolf von Rheinfelden (t 1080) gegen König Heinrich IV. (t 1105) im sogenannten „Investiturstreit" wurde Herzog Bertold I. von Kärnten (t 1078) am 4. Juni 1077 nach alemannischem Recht zum Tode verurteilt und all seiner dignitates (Würden) und beneficia (Lehen) für verlustig erklärt. Unter diesen beneficia befand sich auch die im Pagus Breisgau gelegene Grafschaft (comitatus situs in pago Brisgowe), die Heinrich IV. kaum einen Monat später der bischöflichen Kirche von Straßburg für die treuen Dienste Bischof Werners schenkte. Es ist das erste und letzte Mal, dass wir etwas über die Grafschaft im Besitz der Straßburger Kirche hören. Der begünstigte Bischof Werner starb bereits im November desselben Jahres während eines Kriegszugs in Schwaben. Sein Nachfolger Thiepald (wohl t 1083) wurde nach der Schilderung des gregorianischen Chronisten Berthold von Reichenau (wohl t 1088) durch marchio Bertold II. (t 1111), den Sohn des abgesetzten Grafen im Breisgau und Herzogs von Kärnten, geschlagen. Nach der Sankt Galler Überlieferung unterwarf Bertold II. nach der Einnahme der Burgen Wiesneck und Zimmern den gesamten Breisgau seiner Herrschaft. Spätestens zu diesem Zeitpunkt vermochte der Straßburger Bischof seine Grafenrechte nicht mehr durchzusetzen.

Das Freiburger Münster bildete einen zentralen Pol in der öffentlich-städtischen Religiosität der Stadt Freiburg. Religiöse Verbindungen formten vielgestaltige Beziehungsgeflechte in der städtischen Kultur und umspannten die mittelalterliche Gesellschaft. Auch Universitäten wurden im Mittelalter als geistliche Institutionen verstanden. Mit den zunehmend urbanen Strukturen profilierte sich sowohl von städtischer als auch von kirchlicher Seite eine Vielzahl von Gruppierungen mit eigenen Anspruchshaltungen. Im Brennpunkt des Freiburger Münsters trafen diese aufeinander und kulminierten, wodurch ihm eine Schlüsselstellung in der kirchlichen Praxis Freiburgs zukam.

Als der neu berufene ordentliche Professor für Geschichte, Heinrich Johannes Finke, im April 1899 nach Freiburg kam, befanden sich die Breisgaumetropole und ihre Universität in einer Phase des Aufschwungs. Die seit 1888 von Oberbürgermeister Otto Winterer regierte Stadt zählte an der Schwelle zum 20. Jahrhundert über 60.000 Einwohner. Deutlich wird der Wandel zur Großstadt z.B. am raschen Aufbau einer neuen Infrastruktur, den der offizielle Betriebsbeginn der „Elektrischen Tram" 1901 symbolisiert, oder an den zwischen 1890 und 1906 vollzogenen Eingemeindungen der Vororte Günterstal, Haslach und Zähringen. Die Feier aus Anlass der Immatrikulation des 1.500. Studenten an der Albert-Ludwigs-Universität 1898 und die Zulassung von fünf Frauen zum Studium im Sommersemester 1900, was eine Neuerung in der Geschichte der Hochschulen im Kaiserreich darstellte, spiegeln die wachsende Bedeutung der Freiburger Universität innerhalb der deutschsprachigen akademischen Landschaft wider.

Im Stadtarchiv Freiburg lagert unter der Signatur Cl Militaria 101 , fol. 39r-41v, ein Schriftstück aus dem Deutschen Bauernkrieg von 1525. Es trägt die Überschrift "Handlung vnd feldartickel, so furgenomen worden sind vjf montag nach der alten vaßnacht [ 6. März] von allen hujfen vnd reten, so sich zusammen verpjlicht in dem namen der heilgen vnzerteilten dryvaltigkeit anno etc xvc xxv [1525]" . Unschwer erkennt man in der sorgfältig erstellten Handschrift ein zentrales Dokument aus der Erhebung von 1525 wieder: die in der modernen Geschichtswissenschaft sogenannte „Memminger Bundesordnung". Diese wurde von den Führern der drei oberschwäbischen Bauernhaufen am 6. und 7. März in Memmingen als Verfassung der von ihnen gegründeten „Christlichen Vereinigung" beraten und verabschiedet.' Wenig später wurde sie gedruckt; was die Bedeutung erkennen lässt, die ihr damals beigemessen wurde. Denn nur zwei bäuerlichen Programmschriften, den „Zwölf Artikeln" und der „Memminger Bundesordnung", widerfuhr die Auszeichnung, im Druck bekannt gemacht zu werden. Bei genauerem Hinsehen wird aber auch deutlich, dass die Freiburger Handschrift keine bloße Abschrift des gedruckten Textes war. Durch Streichung, Abwandlung und Hinzufügung von Artikeln war sie vielmehr eine eigene, für sich stehende Fassung der gedruckten „Memminger Bundesordnung" - eine nach ihrem archivalischen Lagerort sogenannte „Freiburger Bundesordnung".